Bon, d'entrée de jeu je vais faire des déçus, une mare écologique n'est pas du tout compatible avec la présence de poissons. Dans la nature il n'y a pas de poisson dans une mare, c'est dans les étangs qu'on les trouve. Une mare "naturelle", c'est une mare où la faune s'installe toute seule, sans apport extérieur, ce qui sera rarement le cas des poissons.

En fait le poisson est un super prédateur, dans un point d'eau il est en haut de la chaine alimentaire (j'exclu le héron, mais lui il est hors de l'eau). La présence de poissons est un énorme frein au développement de la biodiversité aquatique, et encore plus les fameux poissons rouges ou les koïs. Ce sont des espèces qui prolifèrent et dont l'appétit est sans limite, ainsi ils détruisent une partie de la faune et de la flore du point d'eau qu'ils occupent. Par ailleurs ce sont de vrais bulldozzers qui remuent le fond, déracinent, polluent et troublent l'eau.
En plus de s'attaquer aux espèces elles même, c'est à leur habitat que les poissons rouges s'en prennent. Il pourra y avoir des grenouilles et des libellules qui sont venues de l'extérieur dans un bassin à poissons (les tritons cela sera bien plus difficile), mais ils n'arriveront tout simplement pas à se reproduire correctement.

Les amateurs de poissons vous soutiendrons que eux aussi ont des grenouilles (principalement les grosses "rieuses"), mais quoi qu'on en dise, ils auront forcément une richesse de faune et de flore bien moindre que ceux qui n'en ont pas. De plus, d'expérience je peux vous assurer qu'il est largement plus sympa d'observer les batraciens et les gros insectes (libellules, ranatres linéaires, etc...) que de voir des poissons tourner en rond.

J'ai pu constater qu'il était souvent difficile de convaincre les "pro-poissons" de l'impact de leurs petits protégés. On peut toujours les orienter vers les sites sérieux de création de mares qui préconisent absolument tous l'absence de poisson, mais je préfère vous faire part de ce témoignage d'un passionné de la faune aquatique, expert en libellules. Cela se passe en Tchéquie, mais notre adepte est bien français :
"Pour avoir fait pas mal de prospection "libellules" dans la région de Prague, avec environ 300 sites visités pour cartographier la soixantaine d’espèces, je peux vous assurer que les rares sites sans poissons étaient de très loin les plus riches avec environ 40 espèces contre une dizaine pour les autres. Idem pour les batraciens et notamment les tritons. La seule espèce de poisson qui semble respecter la biodiversité est le carassin commun, qui est l’espèce originelle de ces biotopes, mais qui est devenue très rare, car également dévasté par les autres poissons introduits partout. J’ai moi-meme 2 bassins sans poissons et déja 45 espèces de libellules et 6 espèces de batraciens, et pas de moustiques. Les libellules et autres insectes aquatiques, principaux prédateurs des moustiques, parviennent sans probleme jusqu´en centre ville. Les poissons dévorent une bonne partie des larves d´insectes aquatiques et de batraciens, et également la végétation immergée (plantes oxygénantes), où les larves d´insectes et de batraciens se nourrissent, chassent et peuvent se cacher. Par ailleurs, les adultes de bon nombre d´espèces y pondent également leurs oeufs."

Ainsi, si vous souhaitez favoriser la biodiversité, il est vraiment conseillé de s'en passer... Notez par ailleurs que la présence de poissons rouges nécessitera la plupart du temps une filtration mécanique, alors que sans eux une filtration par les plantes suffira amplement.

Evidemment, il n'est pas question de jeter la pierre à ceux qui aiment les poissons et qui en veulent, mais c'est une histoire de choix et il faut admettre que leur présence auront un impact. Un bassin avec des poissons rouges ce n'est pas une mare, c'est un aquarium extérieur...

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Après cette lecture, si vraiment votre envie de poissons reste irrépressible, mais vous voulez tout de même favoriser la biodiversité, il est toujours possible de faire de petites exceptions. En effet, il existe des petits poissons résistants à l'hiver, à priori non invasifs et dont l'impact, à défaut d'être neutre, sera limité.
Il s'agit notamment des Tanichthys gold (les jaunes, les "normaux" vous ne les verrez pas) et des Notropis, petites espèces vives évoluant en bancs. Leur espérance de vie est limitée, mais s'ils se plaisent chez vous ils se reproduiront. Et bien évidemment ils aiment les larves de moustiques, même si dans l'abolue les autres prédateurs naturels suffisent amplement pour les éliminer.

Attention à ne surtout pas mettre de gambusies, espèce autrefois prisée contre les moustiques, mais ils sont très invasifs, prolifèrent particulièrement vite et ils sont désormais interdit à la vente en raison de leur impact sur notre écosystème. Par endroit ils sont jugés responsables de la disparition d'espèces locales dont ils ont pris la place. De manière générale, il est de toute façon hasardeux d'introduire des espèces exotiques dans la nature, certaines ne poseront pas de soucis, d'autres auront des effets vraiment délétères.